Diakoneo betreibt einige Schulen, etwa eine Realschule und ein Gymnasium in Neuendettelsau. Ein erheblicher Teil der Lehrkräfte ist nicht bei Diakoneo, sondern bei der Evangelischen Schulstiftung angestellt. Ihnen empfiehlt Diakoneo jetzt einen Wechsel zu dem Sozialunternehmen selbst.